一揆側の国人、渋川兵部大輔重国と三浦弥兵衛守治が、山川三河守を通じて、政親に詫びを申し入れたが、政親は聞き入れず、一揆側を騙し、その隙に、越中、越前からの援軍を迎え入れ、一揆勢をたたく事を考え、松坂八郎信遠の二千騎を越前口に派遣し、山川自らも千五百騎で、大野、宮腰へ出張して、越中勢を迎え入れ、越前、越中勢と合体して、一揆の背後を攻めようと図ったが、一揆側も山川の叛意を見抜いて、安藤九郎定治が江沼勢三千騎で越前口へ、越智伯耆守吉徳が河北勢を率い、越中口を押えたため、山川の企ては失敗に帰した。

長享元年12月より翌二年５月頃まで、両軍陣営の対峙が続いた。一揆側は、政親と対立していた大叔父富樫泰高を担ぎ出し、総大将に据えた。泰高は家臣二千騎を率いて、野々市の大乗寺に陣を構えた。

６月５日。戦端は開いた。城中より、本郷修理進春親が進み出て、一揆勢を罵る。一揆勢からは、河合藤左衛門尉宣久が出て、口上を言う。

双方の手勢、百五十騎が、矢を打ち合い、夕方には、陣営に引き上げた。

６月６日、大乗寺にて郡議を開き、作戦を練る。

この頃、越中守護畠山政長の家臣松原出羽守信次、竹中岩見守にの軍勢五千余騎が、富樫幸千代党の牢人である阿曽孫八郎盛俊、小杉新八郎基久らの案内で倶利加羅峠より侵入するが、河北の一揆勢が英田(あがた、津幡町）光済寺を大将として、五千余騎で迎え討ち、越中に追い返した。

同じ頃、能登守護、畠山義統(よしずみ)も幕府の出陣催促を受けて、一軍を南下させて来た。河北郡黒津舟（内灘町）の線で、笠間、高橋の一揆勢が、これを迎え討ち、河北郡の一揆勢も河北潟を渡って、能登勢の側背を攻めたので、能登勢はたまらず、敗走してしまう。６月７日早暁より、戦闘開始。四万九千余の一揆勢は一斉に額口(ぬかぐち)の陣に襲い掛かる。城中からは、二千余騎が反撃。一揆勢は、敵をおびき出すため、退却し、城兵が深追いした所を左右より、洲崎、河合の手勢が押し包み攻撃。この合戦で、富樫方は、本郷修理進、額丹後守、高尾若狭守、槻橋弥次郎、斎藤藤八郎、徳光次郎ら、有力武士五百人、雑兵千余人が戦死して総崩れとなり、屋形に火を掛けて山城に立てこもった。夜、政親は、磯部勝願寺と木越光徳寺に書状を送り、妻と子供を脱出させる。

６月８日、朝倉貞景は、堀江中務丞景用、南郷某、杉若藤左衛門、志比の笠松氏らを将とした五千余騎を進発させ、越前、加賀国境の橘（加賀市）より侵入し、陣を構える。大聖寺山に待機していた敷地、福田の一揆勢七千余りが、安藤九郎、金森玄英入道らの指揮で、これに襲いかかり、激戦となるが、翌日、高尾城の陥落が伝えられ、越前勢も兵をまとめて引き上げた。

６月９日、早朝、洲崎慶覚は、ただ一騎で、敵陣を駈け巡り、投降する者は皆助命すると触れ回り、過半の者を投降させ、城中には、政親以下三百人足らずとなる。山川三河守も投降して、越前勝山へ落ちて行った。本折越前守常範も投降したが、一揆弾圧の張本人と見られていたため、末輩数十人に取り囲まれ、惨殺されてしまう。

政親は単身で、大手口より敵中に突入して戦ったが、次第に、山頂の本陣に追い詰められ、最後まで生き残った三十人の家臣とともに自害して果てた。守護代、槻橋近江守重能以下同族七名も自害して果てる。一揆勢は政親の首を取り、大将の泰春の実験に供した。