| 1559年 | 11月 | ヴィレラとロレンソ、京都に上る。石川五右衛門（23）、彼らを助ける。 | |
| 1560年 | ６月 | 父、善次郎（1538−．23）、民家を改装して最初の南蛮寺とする。五右衛門、協力する。 | |
| 1561年 | 五右衛門、京都に『我落多屋』を開く。 | ||
| 1564年 | １月 | 善次郎（27）南蛮人と日本人娘の混血クララ（18）と出会い改宗する。 | |
| 高山右近（13）、ロレンソによって洗礼を受ける。 | |||
| 1565年 | １月 | ヴィレラとフロイス、幕府に新年の挨拶。 | |
| ５月 | マリアとジュリア、京都で生まれる。 | １歳 | |
| ５月19日 | 将軍足利義輝、殺される。 | ||
| ７月５日 | 三好義継の要請により、松永久秀ら天主堂を壊し、宣教師ヴィレラ、フロイスを京都から追放する。 | ||
| 善次郎とクララ、赤ん坊の二人を連れて、堺に逃げる。 | |||
| 1566年 | 善次郎（29）、堺に教会を建てる。 | ２歳 | |
| 1567年 | ８月12日 | 宣教師の京都還住、却下される。 | ３歳 |
| 1568年 | ９月 | 織田信長、足利義昭を奉じて上洛する。 | |
| 1569年 | １月 | 信長、入京する。 | ５歳 |
| ３月11日 | フロイス、高山飛騨守、和田惟政の案内で京都に入る。 | ||
| ４月８日 | フロイス、京都二条城建築現場で信長と会い、京都居住と布教を許される。 | ||
| 善次郎、家族を連れて京都に帰る。 | |||
| ４月20日 | ロレンソと日乗、宗論を戦わし、ロレンソ勝つ。 | ||
| 1570年 | 10月４日 | 山城国西岡の土一揆が入京。幕府、徳政令を出す。 | ６歳 |
| 暮れ オルガンティノ、京都に着く。 | |||
| 1571年 | 春 | カブラル、京都に着く。 | ７歳 |
| ９月12日 | 信長、延暦寺全山を焼く。 | ||
| 1572年 | 善次郎、高山右近（21）に招かれ、家族を連れて高槻に行く。 | ８歳 | |
| フロイス、カブラルを岐阜に連れて行き、信長に歓迎される。 | |||
| 1573年 | ７月 | 信長は義昭を京都から追い出し足利幕府、滅亡する。 | ９歳 |
| 高山飛騨守、高槻城主となる。 | |||
| 善次郎、高槻の天主堂や宣教師の屋敷を建てる。 | |||
| 1574年 | ９月 | 母、クララ（28）、高槻にて病死する。 | 10歳 |
| 1575年 | ７月 | 信長、瀬田橋を修築する。 | 11歳 |
| 10月13日 | 信長、上洛、公家衆の出迎えを受け、妙覚寺に泊まる。 | ||
| 11月 | 善次郎、一人で京都へ行く。マリアとジュリアは高槻に残る。 | ||
| 1576年 | １月 | 善次郎、南蛮寺を建て始める。五右衛門も協力する。 | 12歳 |
| 中旬 | 信長、安土城の普請を始める。 | ||
| ２月 | 信長、京都に新しい二条屋敷を築き始める。 | ||
| ３月 | オルガンティノを招き高槻で復活祭の儀式を盛大に行う。 | ||
| ５月 | 信長、京都から石山本願寺攻めに出陣する。 | ||
| ８月15日 | オルガンティノ、工事中の南蛮寺にて最初のミサを行う。 | ||
| ９月 | 京都奉行村井貞勝の監督のもと、二条城が解体され、安土に運ばれる。 | ||
| 12月 | ジョアン・フランシスコ神父、豊後から着き、降誕祭のミサを行う。 | ||
| 1577年 | １月 | 京都の三階建ての南蛮寺、完成する。盛大な落成式が行われる。 高山父子は大勢の信者を伴い参加する。マリアとジュリアも共に来る。 |
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| ２月 | 善次郎、マリアとジュリアを連れて高槻に帰る。 | ||
| ７月６日 | 信長、京都二条屋敷に正式に入る。 | 13歳 | |
| 10月23日 | 秀吉、京都を発ち、播磨に出陣する。 | ||
| 1578年 | 10月21日 | 有岡城主の荒木村重、信長に背く。 | 14歳 |
| 11月13日 | 信長、荒木対策のため上洛。 | ||
| オルガンティノら高山右近を説得する。多くの信者が信長に捕まり監禁される。 | |||
| 善次郎たちも捕まる。右近が折れ、信者たちは解放される。 | |||
| 1579年 | ５月11日 | 安土城、完成する。信長、落慶式を行い、天主に移る。 | 15歳 |
| ６月 | オルガンティーノ、信長より安土城下に教院を作る事の認可を得る。 | ||
| ９月 | 荒木村重、密かに城を脱出して尼崎城に逃げる。 | ||
| 11月 | 京都の二条御所、完成し、信長は誠仁親王へ献上する。 | ||
| 12月16日 | 信長、荒木村重の一族を京都六条河原で惨殺する。 | ||
| 1580年 | ３月 | マリアとジュリア、善次郎に連れられて、京都に寄ってから安土に行く。 | 16歳 |
| ４月 | 信長、石山本願寺を倒す。 | ||
| 1581年 | ２月 | 安土のセミナリオを完成する。マリアとジュリア、セミナリオの近くの孤児院で働く。 | 17歳 |
| ２月23日 | ヴァリニャーノとフロイス、上京した信長と本能寺で会う。黒人を贈る。 | ||
| ４月 | ヴァリニャーノとフロイス、安土に来る。 | ||
| ５月 | ヴァリニャーノとフロイス、越前北庄に幽閉中の高山飛騨守を訪れる。 | ||
| ６月 | 信長、安土城の抜け穴に南蛮扉を付ける。 | ||
| ６月13日 | 善次郎、何者かに殺される。 | ||